La clause compromissoire constitue un acte à effets procéduraux autonome par rapport au contrat dans lequel elle est insérée, de sorte que sa validité doit être appréciée de manière indépendante en vertu de l'article 808, alinéa 2, du Code de procédure civile ; il s'ensuit que la nullité ou la résolution du contrat principal n'entraîne pas, par voie de conséquence, la clause compromissoire qui y est contenue, l'arbitre étant compétent pour constater l'invalidité alléguée de l'acte substantiel.
La clause compromissoire présente le double caractère d'autonomie et d'accessoriété : elle est un acte structurellement distinct de celui dont découle le rapport substantiel entre les parties, mais elle est en même temps accessoire à celui-ci et instrumentale à la mise en œuvre du règlement d'intérêts conçu par les parties contractantes, une telle qualification se justifiant par la convergence objective des intérêts des parties à déférer aux arbitres les litiges relatifs à un rapport substantiel déterminé.
En présence d'une clause compromissoire, la demande et l'obtention d'une ordonnance d'injonction de payer du juge ordinaire pour la créance découlant du contrat ne sont pas exclues, sous réserve de la faculté pour l'intimé d'invoquer la compétence arbitrale dans le cadre de l'opposition, avec pour conséquence l'obligation pour le juge de l'opposition de révoquer l'ordonnance d'injonction et de renvoyer les parties devant les arbitres.